using System.Web.UI.HtmlControls;

HtmlGenericControl myCss = new HtmlGenericControl();
myCss .TagName = "link";
myCss .Attributes.Add("type", "text/css");
myCss .Attributes.Add("rel", "stylesheet");
myCss .Attributes.Add("href", ResolveUrl(Page.ResolveClientUrl("css文件路径")));
this.Page.Header.Controls.AddAt(0, myCss );

HtmlGenericControl myJs = new HtmlGenericControl();
myJs .TagName = "script";
myJs .Attributes.Add("type", "text/javascript");
myJs .Attributes.Add("src", ResolveUrl(Page.ResolveClientUrl("js文件路径")));
this.Page.Header.Controls.AddAt(1, myJs );